Prinsip sebuahpemotong ultrasoniksama sekali berbeza dengan yang konvensional. Prinsip pemotongan ultrasonik ialah menukar arus 50/60 Hz menjadi tenaga elektrik 20, 30 atau 40 KHz melalui penjana ultrasonik. Ia diubah menjadi getaran mekanikal dengan frekuensi yang sama, dan kemudian getaran mekanik dihantar ke pisau pemotong melalui satu set peranti modulator amplitud yang dapat mengubah amplitud. Pemotong memindahkan tenaga getaran yang diterima ke permukaan pemotong benda kerja yang akan dipotong, di mana tenaga getaran dipotong dengan mengaktifkan tenaga molekul molekul getah dan membuka rantai molekul. Ini amat berkesan untuk memotong bahan likat dan elastik, bahan beku seperti makanan, getah, dan lain-lain, atau objek yang tidak selesa untuk memberi tekanan. Pemotongan ultrasonik juga mempunyai kelebihan besar kerana ia mempunyai peleburan pada titik pemotongan semasa memotong. Tapak pemotong ditutup dengan sempurna untuk mengelakkan tisu longgar (seperti kilatan bahan tekstil). Penggunaan mesin pemotong ultrasonik juga dapat diperluas, seperti menggali lubang, menggali sekop, mengikis cat, mengukir, menggorok dan sebagainya.
Mesin pemotong ultrasonik adalah sejenis peralatan yang menggunakan tenaga gelombang untuk memotong. Ciri terbesarnya ialah memotong tidak menggunakan canggih. Atau, bukannya canggih dalam erti kata tradisional. Pemotongan konvensional menggunakan alat bermata tajam untuk menekan bahan yang dipotong. Tekanan ini tertumpu di tepi pemotongan, dan tekanannya sangat besar, melebihi kekuatan ricih dari bahan yang dipotong. Gabungan molekul bahan ditarik dan dipotong. Oleh kerana bahan ditarik dengan kuat oleh tekanan yang kuat, tepi alat pemotong harus sangat tajam, dan bahan itu sendiri harus menahan tekanan yang relatif tinggi. Ia tidak baik untuk bahan lembut dan elastik, dan lebih sukar bagi bahan likat.
